שמורת טבע מדבר יהודה הינה שמורת טבע גדולה ורחבה הכוללת המון נופים מדבריים. שמורת טבע זו מאופיינת בהרבה נחלים כגון : נחל חימר, נחל צאלים, נחל פרס ,נחל אוג , נחל בוקק , נחל קומראן , נחל רחף , נחל זוהר ועוד.
מעבר לנחלים שבחודשי החורף שישי שיטפונות זורמים בעוצמה מטורפת !!.
יש במדבר יהודה מצוק יפהפה העוהר ממש מעל ים המלח הנקרא מצוק העתקים. זהו רכס ארוך של צוקים שנמצאים בתוך השבר הסורי -האפריקני. דרכו עוברים מספר מנחלי מדבר יהודה למשל נחל סלוודורה ונחל דרגה.
בגלל שמצוק העתקים עשוי מסלע קירטון רך הגשמים חוצבים ויוצרים בו ערוצי נחל רבים . בתוך אזור קניוני.
חלקה הדרומי של שמורת מדבר יהודה שונה קצת מחלקה המצפוני הוא כולל את הר סדום. שעשוי גבישי מלח , באזור זה מערות מלח. כמו כן באזור זה נמצא רכס חצרה שעובר במכתש הקטן.
גם נחל צין הגדול בנחלי המדבר עובר כאן.
